虛擬篩選服務
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虛擬篩選服務
隨著科技的發展，當前已經擁有龐大的生物分子數據庫以及各種各樣的藥物分子數據庫，而傳統的實驗手段已經難以從龐大的數據庫中快速的篩選出符合特定需求的分子體系。目前我們已經可以通過分析確定藥物的作用機制，并在此基礎上通過計算機模擬篩選的方式快速的篩選出符合特定條件的一系列分子，從而大大的加快分子篩選過程。
據統計數據顯示，成功研制一種新藥需要約10—12年的時間，耗資10億—15億美元。計算機輔助藥物設計技術能通過干涉新藥發現流程，大量降低研發成本和時間，增加社會經濟效益， 國內外利用CADD輔助藥物設計工具取得了非常了不起的成績。
實體的藥物篩選方法有嚴重的缺點：成本高、效率低、速度慢、樣品量大、陽性率低（< 0.1‰）。相比之下，虛擬篩選（virtual screening, VS）方法具有很大的優勢。采用高通量虛擬篩選方法可從大型化合物庫（如約20萬個化合物的SPECS庫，超過1億個可購買化合物的ZINC庫）中迅速篩選出有潛在活性的藥物分子，陽性率一般在5%~20%。
我們理解大多數研究者對虛擬篩選準確率低、假陽性率高的詬病，這些問題通常來自于傻瓜式的操作和對研究體系缺乏充分了解。
盡管針對藥物設計的軟件和策略層出不窮，但被運用來尋找到有效的苗頭化合物，進而發展成先導化合物，是極其艱難的一件事情。
在整個藥物發現的過程中，布滿了各種陷阱，不少是非常隱秘的。
對一個全新的體系采用單一方法進行虛擬篩選，其準確率往往遠低于文獻報道的研究結果。
研錦生物深諳每種方法都有其固有的缺陷，因此，在充分了解研究體系的情況下，我們通常采用多模型方案與平行和（或）串行的篩選策略，并根據先驗的成功概率和后驗的命中率仔細挑選策略和設計方案，借助統計學這一強有力的工具，提高我們對篩選策略的成敗把握。
值得注意的是，我們的專家知識在提高命中率上給了很大幫助，這歸功于研錦生物多年積累的豐富經驗。
研錦生物在藥物的虛擬篩選方面進行過大量研究，有著豐富的實踐經驗和核心技術。根據具體的研究項目，我們將為客戶提供有針對性的高性價比的篩選方案。同時，還可提供小分子化合物庫等服務。
高通量高精度分子對接（Docking）
基于形狀匹配的分子相似度計算（Shape-based Similarity）
基于配體或受體的藥效團構建與篩選（Pharmacophore）
反向尋靶（Target Fishing）
虛擬篩選庫類別 | 說 明 |
ZINC全部可購買庫 | 化合物數量19582419個 來源于ZINC數據庫，能購買到，適用于大規模的虛擬篩選。 |
ZINC先導化合物庫 | 化合物數量6184622個 來源于ZINC數據庫，能購買到，分子量在250~350，logP<=3.5，可旋轉鍵數目<=7。 |
ZINC類藥化合物庫 | 化合物數量15009925個 來源于ZINC數據庫，能購買到，分子量在150~500，logP<=5，可旋轉鍵數目<=7，tPSA<150, HBD<=5,HBA<=10。 |
ZINC片段庫 | 化合物數量667834個 來源于ZINC數據庫，能購買到，分子量<250，logP<=3.5，可旋轉鍵數目<=5。 |
ZINC天然產物庫 | 化合物數量25萬個 來源于ZINC數據庫，其中大部分在售，有些不能購買。 |
中草藥成分庫（VIP免費篩選） | 化合物數量33765個 中草藥成分庫涵蓋了8445種中草藥，包括發散風寒藥、發散風熱藥、清熱瀉火藥、清熱燥濕藥、清熱解毒藥、清熱涼血藥、清虛熱藥、攻下藥、潤下藥、峻下逐水藥、利水消腫藥、利水通淋藥、利水退黃藥、理氣藥、止血藥等。 |
供應商Chembridge | 化合物數量653850個 來源于Chembridge，包含類藥化合物和先導化合物。 |
供應商Chemdiv | 化合物數量1261245個 來源于Chemdiv，總量大，具有超過14,000種母核，多樣性豐富，新化合物多。 |
供應商Enamine | 化合物數量1393713個 來源于Enamine，數量大，多樣性豐富。 |
供應商InterBioScreen | 化合物數量441574個 來源于InterBioScreen，多樣性豐富。 |
供應商Lifechemicals | 化合物數量368367個 來源于Lifechemicals，多樣性豐富。 |
供應商Maybridge | 化合物數量61756個 來源于Maybridge，多樣性豐富。 |
供應商Specs | 化合物數量200187個 來源于Specs，多樣性豐富。 |
庫存-農藥庫 | 化合物數量172254個 涵蓋了除草劑、殺蟲劑、殺菌劑等農藥化合物分子，有庫存，購買方便。 |
庫存-片段庫 | 化合物數量102309個 分子量<300，有庫存，購買方便。 |
庫存-上市藥物庫 | 化合物數量2798個 包含被批準（FDA、EMEA或其他機構批準）的藥物分子，具有化學多樣性、已知的生物藥效率以及安全性，降低藥物篩選風險，有庫存，購買方便。 |
庫存-特殊品種化合物 | 化合物數量1215個含特殊品種的化合物 包括核受體的配體小分子化合物、離子通道配體小分子化合物、腎上腺素受體的配體小分子化合物等化合物種類，有庫存，購買方便。 |
天然產物庫 （VIP免費篩選） | 化合物數量7507個 庫中包含的天然產物來源于植物、動物以及微生物，分子結構多樣性豐富，幾乎涵蓋大部分已知的天然產物結構類型，有庫存，購買方便。 |
庫存-已知活性庫 | 化合物數量35417個 包含了已知活性或靶點明確的小分子化合物，包括一些上市藥物化合物，適用于老藥新用、藥物靶點機制研究和陽性化合物對照等，有庫存，購買方便。 |
寶雞市辰光生物科技有限公司化合物庫 | 化合物數量637個 來源于植物天然產物，包含皂甙類、黃酮類、生物堿類等。 |
FDA批準的藥物 （VIP免費篩選） | 化合物數量2388個FDA批準的藥物的結構。 |
實驗中的藥物 （VIP免費篩選） | 化合物數量5166個實驗中的藥物。 |
小分子肽庫 | 小分子肽庫中的結構為計算得到的小分子結構，由20種氨基酸任意組合形成的二肽、三肽、四肽結構，數目分別為400個、8000個、16萬個。 |
研錦生物可以利用基于靶點或小分子結構的藥物設計方法，對可購買化合物、天然產物等數據庫進行虛擬篩選，并獲得潛在活性的化合物列表供進一步活性實驗確證。
面向制藥企業和科研院所，可提供一站式的早期藥物研發服務，包括虛擬藥物篩選、先導優化、靶標預測、 動力學模擬等，涉及小分子化學藥、生物藥、中藥等多種新藥類型，為您提供優質的藥物發現服務。
